DNAを配列特異的に切断する制限酵素はその反応条件によって認識配列が変化する場合 がある。たとえばEcoR Iは通常GAATTCという配列を認識し切断する。しかしなが ら、反応溶液中にMn²⁺が存在すると両端の配列に対する特異性が失われAATT を含む6塩基を認識し切断するようになる。このような本来の認識配列以外に対する活性 のことを「スター活性」と呼ぶ。

　よく使われる制限酵素では以下のようなスター活性が知られている。

BamH I

　　GGATCC　　通常の認識配列
　　GAATCC　　スター活性配列
　　GGNTCC　　スター活性配列
　　GGANCC　　スター活性配列
　　GGATTC　　スター活性配列
　　　条件
　　　　　・高濃度グリセロール
　　　　　・Mn²⁺
　　　　　・DMSO
　　　　　・低イオン強度

EcoR I

　　GAATTC　　通常の認識配列
　　NAATTN　　スター活性配列
　　　条件
　　　　　・高濃度グリセロール
　　　　　・Mn²⁺
　　　　　・DMSO
　　　　　・低イオン強度

EcoR V

　　GATATC　　通常の認識配列
　　AATATC　　スター活性配列
　　GNTATC　　スター活性配列
　　GANATC　　スター活性配列
　　GATNTC　　スター活性配列
　　GATANC　　スター活性配列
　　GATATT　　スター活性配列
　　　条件
　　　　　・DMSO

Hind III

　　AAGCTT　　通常の認識配列
　　GAGCTT　　スター活性配列
　　ANGCTT　　スター活性配列
　　AAKCTT　　スター活性配列
　　AAGMTT　　スター活性配列
　　AAGCNT　　スター活性配列
　　AAGCTC　　スター活性配列
　　　条件
　　　　　・Mn²⁺
　　　　　・DMSO